保姆级 MIMIC 安装教程!临床科研人必备的数据库上手指南

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MIMIC数据库

在临床科研中，MIMIC-IV 数据库作为重症医学领域的经典公开数据集，是开展临床预测模型、疾病机制研究的重要基础，基于它的研究成果更是频频见刊。

但对于很多科研人来说，从获取数据库使用权限，到本地完成 PostgreSQL 部署、数据导入与验证，整个安装流程步骤繁琐、细节繁多，稍不注意就容易踩坑卡壳。

本文整理了 MIMIC-IV 数据库从工具准备、权限申请到本地安装、数据验证的全套实操流程，全程干货无废话，附带关键代码与操作截图，不管是刚接触的科研新手，还是安装遇阻的老手，都能跟着一步步搞定 MIMIC-IV 数据库本地部署，让你的临床科研少走弯路！

准备工作

（一）下载工具：

1. postgreSQL安装包（用于数据库的管理与操作（https://www.postgresql.org/））

2. 7z安装包（用于解压大型的压缩包（https://www.7-zip.org/））

3. MIMICIV数据库安装脚本（下载网址：https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/main）

4. MIMICIV数据集压缩包

（二）安装软件

1. PostgreSQL：

注意安装的时候确保磁盘空闲空间大于100G，直接点击安装包程序即可进行安装，在选择安装目录时尽量不选择C盘，以免数据量太大导致电脑卡顿。安装后续过程中会要求给数据库设置超级管理员密码，用户名为postgres，此处设置的密码一定要记住，在后续使用PostgreSQL打开数据库时会多次用到。后续安装步骤选择默认即可。

2. 7-Zip解压缩软件

双击下载的7Z安装包即可，对应设置自己需求的安装路径，并且需要记住这个安装路径，后续配置环境变量的时候需要用到。

3.配置环境变量

设置7Z的环境变量的原因是为了让MIMIC导入脚本能够找到7Z命令。

win+I快捷键，调出系统设置，搜索环境变量

点击确定，环境变量配置成功。

（三）注册账号

1. 访问PhysioNet

2. 注册账号并验证邮箱

（四）完成认证课程

要申请mimic数据库的使用权限，需要有CITI证书，获取证书需要先通过考试。考试内容包括十几个模块，每个模块做完之后可以查看答案，并且可以重复作答。完成后下载证书即可（PDF）

（五）申请数据库访问权限

权限申请网站：https://physionet.org/settings/credentialing/

点击进去填写信息即可。

（六）提交CITI课程报告

完成后等待官方审核即可，一般在1-5个工作日。

数据安装

使用官方提供的数据安装代码，即前面下载的MIMICIV数据库安装脚本。

打开安装好的PostgreSQL数据库，输入管理员密码

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