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从0开始:Codex的安装、配置以及在生信中的应用交流群

从0开始:Codex的安装、配置以及在生信中的应用交流群

大家应该感受到了目前AI的火热,生信技能树目前也写了比较多的帖子进来了。比如下面这些,但是目前市面上关于AI在生信中到底如何使用相关的教程依旧大量缺乏!技能树在这里直接开个群直播带领大家从0开始配置,进群方式见文末。

目前AI相关教程都存在这个专辑里面:大模型专辑:100个生信案例

关于Agent智能体(人的身体、四肢)方面的

codex:让codex帮我配置新买的一台生信人专属的Mac电脑,效果如何呢?

claude code:菜鸟新叶带你:从0开始配置Claude Code!

openclaw:我也有小龙虾了🦞:从0开始配置 openclaw

opencode:跟着新叶上道AI工具OpenCode:配置GLM-5.2模型(与Claude Fable 5一争高下)

zcode:Ollama:使用 Claude Code 与 GLM-5.2 进行 Vibe Coding 的配置指南

Cursor:Cursor初学者使用指南

workbuddy:这个待补充

YH开发的R生态中的智能体 aisdk:

关于LLM使用(人的大脑)

使用大语言模型(LLM),有哪些模型呢?

kimi:https://www.kimi.com/(网页版)

deepseek:跟着菜鸟新叶上道:codex也能接入deepseek了!

GLM:智谱的GLM5.2模型实力如何:找学习资料实在是强!

chatGPT:一个简单的生信分析初次感受到了chatgpt与deepseek写代码的差距

Gemini:google https://gemini.google.com/app?referrer=AISTUDIO

claude Fable5:这个也有

关于哪里买模型?

买了之后会得到配置方法和使用的钥匙即API。

有哪些模型:AI工具千千万,新手到底怎么选?看这一篇“导航”就够了!

硅基流动:

https://cloud.siliconflow.cn/i/O5idSDBx 注册会有一个免费的16块钱额度

最新支持 GLM-5.2、MiniMax-M3、DeepSeek-V4 系列、Doubao-Seed-2.0 系列、Kimi-K2.6 等模型

deepseek官网:

https://platform.deepseek.com/usage

火山引擎:

立即订阅:https://volcengine.com/L/IPDtf2M03Rc/  邀请码:82TYN5CU

方舟 Coding Plan 最新支持 GLM-5.2、MiniMax-M3、DeepSeek-V4 系列、Doubao-Seed-2.0 系列、Kimi-K2.6 等模型,工具不限,现在订阅叠加9.5折,低至9.4元,订阅越多越划算!

API:https://console.volcengine.com/ark/region:ark+cn-beijing/apiKey?apikey=%7B%7D

模型查看:https://console.volcengine.com/ark/region:ark+cn-beijing/openManagement?LLM=%7B%7D&OpenModelVisible=false&vtm=a106466.b106468.0_0.0_0.0.138_7656404106270443062&advancedActiveKey=subscribe

GLM5.2云端模型ollama:

访问 ollama.com 注册并订阅 Cloud 套餐,GLM-5.2 的 Cloud 版本无需本地 GPU,推理全部在云端完成,运行起来非常丝滑。

套餐:https://ollama.com/pricing

使用量:https://ollama.com/settings

chatgpt pro:中转

Claude原生模型:中转

不同模型切换:菜鸟上道CC Switch:一键切换claude code多个 API 站点,可视化查询token用量!

Skills系列:

给 Claude Code 装上生信绘图的翅膀:Bizard SKILLS

专属生信人的skills:安装上这个你就是一个全栈生信分析工程师了!

最新综述:60 多个生物LLM智能体系统,有单细胞+空转等

融了 1600 万美元的智能体里面的skills好用吗?用一个实战看看!

opencli:打开AI时代的学习方式,公众号专辑蒸馏为skills:想蒸馏哪个就蒸馏哪个!

让AI用你的浏览器干活:OpenCLI

熊言熊语最近开源了他的科研技能:https://github.com/fei0810/bear-research-skills

AI 帮你查文献,绝不编造引用——bear-research-skills:8 个科研分析 Agent Skill

YH:当 AI 答不上"PubMed 怎么查":一次为科研工作流定制一个 Skill 的全过程

AI生信实战

仅用一句话让 Claude Code 帮我下载zenodo上的全部数据!

没有OrgDB包的物种基因ID转Symbol怎么办?一句话丢给AI就干好了!

codex给新macbook一口气安装1400+的R包:不费吹灰之力!

当我让codex给我一份新手mac电脑使用指南

codex版本:初学者也能学会的单细胞h5ad与seurat对象互换(手搓代码也有!)

连接服务器:

设置codex连接服务器使用专线下载蛋白数据(服务器不需要安装codex)

给新手一份更简单的R安装指南:服务器新的R4.6环境配置

AI整理资料:

用AI下载免疫组库相关的资料和文献:纵享高速和丝滑!

AI带我系统学习代谢组学(一):超全的学习资源,代谢组学概念和分析pipeline

智谱的GLM5.2模型实力如何:找学习资料实在是强!

智谱GLM5.2写代码:丝滑解决一个学员的疑问 SRR10804560

AI生信绘图:

新的绘图打开方式:codex一句话完美复现高分杂志同款小提琴图!

使用AI复现NC同款高颜值ROC曲线:三步搞定!

关于AI的思考

当 AI 开始替我走路以后

"为了醋包了一顿饺子":科研与AI圈的虚火该降降了,一起看看大模型的7个错误方向

AI 都会写代码了,我还要从零学生信吗?

AI 正在悄悄"改写"生信工程师的命运:你是被放大,还是被淘汰?

Codex的生信学习交流群

即使有上面这么多资料,你是否也遇到过:

🔹 文档读不懂、代码报错没人问

🔹 教程碎片化,学完不知道怎么串起来

🔹 单干太寂寞,想找人一起啃硬骨头

现在生信技能树免费构建了一个 Codex 生信学习交流群,欢迎一起交流分享 ✊。

🎯 群内方向:转录组 / 单细胞 / 多组学分析、Linux+R+Python 实操、流程搭建(Snakemake/Nextflow)、AI 辅助编程(Codex/Claude)、文献复现、数据可视化……

👤 适合人群:生信小白到进阶玩家,硕博在读 / 科研工作者 / 产业同行 💡 群内氛围:纯交流,无广告,禁灌水,鼓励提问和分享

📥 进群方式:

群二维码如下,先到先得:

如果上面的二维码满了,这个时候有我们的拉群小助手拉大家进去了,请备注:姓名+单位+codex。不然可能通不过加好友哦。