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全套AI抗体设计工具、千元级别算力赠送,“长江杯” x MatwingsVenus(晓鹜)参赛指南来了!

全套AI抗体设计工具、千元级别算力赠送,“长江杯” x MatwingsVenus(晓鹜)参赛指南来了!

“长江杯”全球AI蛋白质设计挑战赛

靶点公布在即!

本次大赛赛题方向为VHH与Minibinder设计

晓鹜®平台现已提供覆盖两类任务的

完整设计与验证工具链!

👇👇👇

天鹜科技作为本次大赛的赞助与支持单位

比赛期间

MatwingsVenus®(晓鹜®)平台

将为所有参赛选手

赠送10万平台积分!

全新上线的晓鹜®Token平台

将为所有参赛选手

赠送价值100元的Token券!

(可以调用GLM-5.3-flash、DeepSeek-V4-Flash-1017等模型,支持DeepSeek Harness、Pi Agent、CodeX、Claude Code、CC-Switch等多种AI编程工具)

无论你是希望更高效地调用de novo设计工具

还是首次接触AI蛋白设计

都可以通过晓鹜平台完成相关设计与计算流程

接下来几天,我们还将陆续发布

晓鹜®平台de novo蛋白设计系列教程

期待在长江杯,看到你的设计!

免费试用MatwingsVenus®(晓鹜®)平台

https://matvenus.com/ 

立即注册晓鹜®Token平台

https://token.matvenus.com/

01

参赛“专属积分支持”

从今日起,晓鹜®平台将为所有长江杯参赛选手,免费赠送10万平台积分,队长和队员均可领取,用于比赛期间的设计与计算。

获取方式

① 扫描下方二维码,填写报名时使用的邮箱

② 积分兑换码将发送至该邮箱,注意查收

③ 注册/登录晓鹜®平台https://matvenus.com/

(*请勿将兑换码在注册时填入邀请码位置)

④ 点击左下角头像,进入【我的积分-兑换码】窗口,输入收到的兑换码

⑤ 积分即时到账,即可用于比赛设计

02

参赛“专属Token支持”

晓鹜®Token平台全新上线,将为所有长江杯参赛选手,免费赠送价100元的大模型(GLM-5.3-flash、DeepSeek-V4.1-flash-1017)Token,队长和队员均可领取。

获取方式

① 访问晓鹜®Token平台https://token.matvenus.com/,使用手机号注册登陆

② 扫描下方二维码,填写大赛报名邮箱与晓鹜®Token平台注册手机号

③ Token将会在24小时内发送至该账号,注意查收

如在注册、领取积分/Token过程中遇到任何问题

欢迎扫码添加官方客服微信

或扫码加入官方交流群

我们会第一时间帮你处理!

03

晓鹜®平台能力概览

针对本次赛题的

VHH纳米抗体和Minibinder设计

平台提供从靶点调研、结构预处理、序列设计

到结构验证、界面评估等全流程功能

覆盖设计、验证与优化各环节

靶点调研

设计前,可通过平台对主办方给定的靶点进行信息确认与背景调研,包括序列与注释、三维结构、已知结合物与配体、相互作用与界面证据,以及相关文献和专利检索。

调研目标

平台资源

靶点身份与序列

UniProt、BLAST、Foldseek

三维结构

PDB / PDBe、AlphaFoldDB

已知结合物与配体

BindingDB、ChEMBL、

Open Targets

相互作用与界面

BioGRID、STRING、PDB

文献

PubMed、arXiv、

Semantic Scholar

专利

PatSnap

结构预处理

  • 平台支持 CIF/PDB、SDF/MOL2/PDBQT 等常见结构格式转换

  • 并提供加氢、按 pH 质子化、结构裁剪等预处理功能。

VHH 纳米抗体设计能力

台提供两种互补的VHH设计模式,可根据已有结构基础与设计需求选择:

设计路线

工具

方式

从头生成 VHH

mBER

无需提供抗体框架,针对目标抗原直接生成候选 VHH 序列与结构

基于框架进行 CDR 设计

RFantibody

在给定 FR1–FR4 框架的基础上,对 CDR 区域进行设计与优化,并输出符合 IMGT / Chothia 编号规范的候选结构

Minibinder 设计能力

平台覆盖三条从头结合蛋白设计的主流技术路线:

设计路线

工具

方式

骨架生成与序列设计

RFdiffusion 1/2 

ProteinMPNN

LigandMPNN

根据目标蛋白生成候选结合骨架,并进一步完成序列设计;LigandMPNN 可用于包含配体、金属或辅因子的设计场景

骨架–序列联合设计

BindCraft

基于 AF2 进行结构生成与序列优化,并结合界面质量等指标对候选结果进行筛选

基于结构约束的生成设计

BoltzGen

根据目标结构、结合位点或其他设计约束生成候选复合物结构

结构预测与对接

验证需求

工具

关注指标/用途

全原子结构预测

VenusFold

pLDDT、PAE、结构一致性

蛋白复合物预测

AlphaFold2

(multimer)

ipTM、pTM、pAE、界面置信度

单体快速折叠初筛

ESMFold

折叠置信度

多实体复合物预测

Protenix

蛋白/配体/核酸/金属等复合物结构预测

蛋白–蛋白对接

HDOCK

ZDOCK

结合姿态、界面一致性

界面分析与计算优化

工具

能力

PLIP

自动解析氢键、疏水接触、盐桥、π 堆积、卤素键、水桥

PyMOL

界面图、热点图、表面与卡通图等展示级图像

以上展示的全部抗体设计工具

现均已上线MatwingsVenus®(晓鹜®)

我们致力于成为一款轻量、易上手的

面向生命科学研究与设计的AI平台

工具已就位

系列教程即将陆续上线

欢迎体验晓鹜®平台

期待在“长江杯”看到你的设计!

*声明:用户使用晓鹜®平台生成的蛋白质设计序列及相关结果,其知识产权归属于用户或用户所在团队。用户应对输入内容及生成结果的使用、发布和商业化行为自行负责。平台输出的结构与评分均为计算预测,不保证实验结果或商业应用效果。参与“长江杯”大赛的用户,参赛作品的知识产权及使用以主办方公布的赛事规则为准。

MatwingsVenus®(晓鹜®)是天鹜科技自主研发的一款AI驱动的干湿闭环蛋白质研发平台,目前,该平台已在创新药、合成生物学等核心领域落地多个标杆应用案例;并成功入选WAIC2026「镇馆之宝」,为该届唯一入选榜单的AI4S(科学智能)产品。其基座模型VenusREM在哈佛医学院的ProteinGym榜单上长期位居榜首,并在哈佛大学最新发布的预印本PG-LLM评测中,成为蛋白突变预测行业对标权威参照。

平台包含两大核心模块:轻量级AI生物设计平台,集成丰富科学工具,支持用户以自然语言完成蛋白质研发全流程任务,涵盖深度调研、序列设计、结构预测等关键环节;AI黑灯实验室,可与设计平台无缝衔接,自动执行核心实验流程,形成智能研发闭环。平台同时提供重组蛋白、蛋白纯化工具等标准化产品,以及智能体私有化部署、FDE定制开发等灵活解决方案,覆盖从早期探索到产业转化的多元研发需求。

平台致力于推进蛋白质前沿研发能力普惠化,助力个人研究者与中小科研团队高效调用优质共享科研资源,快速实现科研想法到落地成果。除个人在线注册使用之外,企业版服务也已正式上线,诚邀各行业伙伴垂询合作。

天鹜科技是一家专注于生命科学领域的人工智能公司,致力于打通计算设计、湿实验验证、工艺放大与商业化应用。公司现已面向生物医药、生物制造等领域,提供覆盖研发、中试、生产及质量控制的全链条AI解决方案。自主研发的干湿闭环蛋白质研发平台 MatwingsVenus®(晓鹜®),也正助力个人与生物企业提升研发效率,加速创新成果从设计走向规模化生产。

公司先后荣获国家高新技术企业、上海市专精特新中小企业等多项荣誉称号,及“创客中国”AIGC专题赛全国一等奖、“创客中国”企业组全国二等奖、上榜工信部第一批人工智能在生物制造领域典型应用案例、第五届“海聚英才”全球创新创业大赛铜聚奖等,目前已完成数轮融资,投资方包括上海国投先导、国投创新、中国石油昆仑资本、启明创投、涌铧投资、上海未来产业基金、本草资本、金沙江联合资本等多家知名投资公司。

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