夜雨聆风学习资料网

ARTICLE · 1084244

是什么AI工具,拿下2024诺贝尔化学奖,破解蛋白质折叠难题?

是什么AI工具,拿下2024诺贝尔化学奖,破解蛋白质折叠难题?
不用昂贵实验设备,AI如何算出蛋白质的螺旋三维结构?AlphaFold2到底厉害在哪?为什么能颠覆生命科学研究?
蛋白质是生命的基石。一条由氨基酸串联而成的长链,会在细胞内自发折叠,形成复杂三维构型,其中就包含我们熟知的α‑螺旋、β‑折叠等螺旋二级结构。蛋白质的折叠形态直接决定它的功能。过去半个世纪,科学家一直面临巨大难题:只知道氨基酸排列顺序,怎么推算出蛋白质的螺旋与立体折叠形态?这就是著名的“蛋白质折叠问题” 。
2024年诺贝尔化学奖,将奖项授予了这项AI突破。谷歌DeepMind团队的哈萨比斯与江珀,开发出人工智能模型AlphaFold2(阿尔法折叠2),实现了蛋白质三维结构的高精度预测,能够解析蛋白质内部的螺旋、卷曲、片层等精细空间结构,一举攻克了这一困扰学界五十年的难题 。
在AlphaFold2问世以前,想要得到蛋白质的螺旋立体结构,只能依靠冷冻电镜、X射线晶体衍射等昂贵实验手段。解析一个蛋白,往往耗费数月乃至数年时间,大量蛋白因为难以结晶,根本无法解析。而AlphaFold2只需要输入蛋白质的氨基酸序列,就可以在几分钟之内输出接近实验精度的三维模型,清晰还原α‑螺旋、β‑折叠等关键二级结构,极大降低了研究门槛 。
AlphaFold2并不是简单的查表,它依靠深度学习神经网络,学习海量已经实验解析完成的蛋白质数据,学习氨基酸之间的相互作用规律,预测每一个原子在空间中的位置,从而复现蛋白质的折叠与螺旋形态。这套模型公开之后,已经被全球190多个国家超过200万科研人员使用,建立起包含2亿条蛋白结构的公开数据库,极大推动了药物研发、抗生素耐药研究、塑料降解酶挖掘等众多领域 。
值得区分的是,2024诺奖还有另一位获奖者戴维·贝克。贝克的工作是蛋白质计算设计,代表工具为RoseTTAFold、ProteinMPNN。它的方向和AlphaFold2正好相反:AlphaFold2是“从序列预测天然蛋白的折叠结构”;贝克团队则是从零设计自然界不存在的全新蛋白质,制造具备全新功能的蛋白,用于疫苗、纳米材料等领域 。
AlphaFold2的成功,标志AI正式走进生命科学核心研究。它并没有完全取代传统实验,AI预测的螺旋结构仍然需要实验验证;但它大大缩小了实验的探索范围,为生物医学打开全新窗口。从理解疾病机理,到开发新药,AI正在帮助人类读懂生命分子里那一圈圈精妙的螺旋密码。
附件:2024诺贝尔化学奖AI工具:
AlphaFold2(阿尔法折叠2),由Google DeepMind的Demis Hassabis(哈萨比斯)、John Jumper(江珀)开发,用来根据氨基酸序列,预测蛋白质三维折叠结构(包含α‑螺旋、β‑折叠等二级螺旋结构) 。
2024诺贝尔化学奖分两部分:
一半:哈萨比斯、江珀,表彰AlphaFold2蛋白质结构预测(解决困扰生物学50年的“蛋白质折叠问题”) 。
另一半:David Baker(戴维·贝克),表彰计算蛋白质设计,他团队的工具为RoseTTAFold、ProteinMPNN,用来从头设计全新蛋白质,不是预测已有蛋白结构 。
AlphaFold2在2020年发布,2024年获奖;2024年5月又发布升级版AlphaFold3,可预测蛋白‑配体、蛋白‑蛋白复合物结构 。过去实验解析蛋白质螺旋、折叠结构,需要X射线晶体衍射、冷冻电镜,耗时数月甚至数年;AlphaFold2只需要氨基酸序列,几分钟就能算出原子级三维结构,包含α‑螺旋(你说的蛋白质螺旋)、β‑片层等二级结构。
参考文献:
[1] Jumper J, Evans R, Pritzel A, et al. Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold[J]. Nature,2021,596(7873):583‑589.
[2] The Royal Swedish Academy of Sciences. Nobel Prize in Chemistry 2024[R]. Stockholm: Nobel Foundation,2024.
[3] Baek M, et al. Accurate prediction of protein structures and interactions using a three‑track neural network[J]. Science,2021,373(6557):871‑876.
[4] 张健, 陈军. AlphaFold2对生命科学研究的变革与局限[J].生物工程学报,2023,39(2):489‑502.
(图片来源网络,如有侵权联系删除!)
1、医保飞检:精神科病历合理性到底怎么查?
2、精神科病历书写防罚:阴性结果被罚款?别喊怨——罚的不是“阴性”,是“没分析”
3、你有没有想过,病历里的一句“患者不配合”,可能会变成一颗“定时炸弹”?
4、精神科病历雷同的认定,到底关联哪些关键要素?
5、卫健委与医保局病历要求冲突时,临床医生该听谁的?
6、当生命走到终点:医院里的“最后一页病历”该怎么写?
7、精神科主诉的'黄金法则'是什么?
8、特殊人群主诉怎么写?抓“发育”与“退化”
9、电子病历什么情况下可以改?改了怎样才不算篡改?
10、精神科医保申诉中,如何提高申诉成功率?

请点亮“在看”,谢谢支持!

相关学习资料