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你们追着问的“巨噬细胞”发文模版来了!“单细胞+体内外实验验证”,跟着上交大团队“三步走”,发文11分+不迷路!

你们追着问的“巨噬细胞”发文模版来了!“单细胞+体内外实验验证”,跟着上交大团队“三步走”,发文11分+不迷路!

很久之前有人问我热点有没有发文模版,课题窗带着这个问题仔细回忆了一下之前看到的文章,还真找到了一篇。

这是上海交大团队发表在J Exp Clin Cancer Res上的内容,研究的是“SPP1阳性巨噬细胞(SPP1+Macs)”,内容上不仅有scRNA分析,还有体内外实验加以验证,干湿结合揭示了它可以作为治疗头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的候选靶点。

虽然这篇文章看起来内容复杂,但其实仔细解析后就能把它拆分为三步:scRNA揭示SPP1+Macs的作用并验证—细胞功能实验验证—体内实验验证,逻辑上层层递进,结果也很完整。如果你想从巨噬细胞入手发文,按照这个套路,换个疾病就能复现,这不就是一个很好的模版吗?

课题窗在国自然热点上研究了这么多年,无论是科研选题还是标书方案设计都很擅长,如果你对自己的研究思路把握不准,欢迎各位小伙伴们来咨询!

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题目:SPP1+巨噬细胞通过分泌TNF - α和IL - 1β促进头颈部鳞状细胞癌的进展

期刊:J Exp Clin Cancer Res

影响因子:11.4

发表日期:2024.12.26

研究背景

头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是一种侵袭性很强的疾病,其特征是肿瘤免疫微环境异质性(TIME)。SPP1 +巨噬细胞(SPP1 + Macs)存在于许多癌症中,但其对HNSCC的影响尚不清楚。本研究旨在确定和验证SPP1 + Macs在HNSCC恶性进展中的作用和功能。

研究思路“三步法”

第一步

通过scRNA鉴定具有临床特异性SPP1+Macs,并分析其在肿瘤免疫微环境中的分布和功能,并通过RT-qPCR、IHC和mIHC在临床样本中进行验证。

(研究结果:研究通过对71539个细胞的转录组分析,将其分为了9种细胞类型和14个细胞簇。揭示了SPP1+巨噬细胞亚群在肿瘤组织中比例显著较高并且高度浸润,能够通过分泌细胞因子上调肿瘤细胞和巨噬细胞中OPN表达。)

第二步

通过构建了从THP-1细胞分化而来的SPP1-OE巨噬细胞和SPP1-KD巨噬细胞,采用Luminex液悬芯片检测方法检测细胞因子差异,并进一步评估其在几种HNSCC细胞系和邻近巨噬细胞中的生物学功能和机制。

(研究结果:研究发现SPP1+巨噬细胞显著增加了TNF-α和IL-1β的分泌,促进了HNSCC细胞的增殖和迁移能力。WB和GSVA分析显示NF-κB信号通路显著被激活,相应磷酸化水平升高,而使用NF-κB抑制剂后这些现象显著被抑制)

第三步

通过体内实验验证SPP1 + Macs在HNSCC进展中的作用。

(研究结果:最后的体内实验进一步验证了上述结果,即SPP1+巨噬细胞通过分泌TNF-α和IL-1β促进肿瘤生长,当TNF-α和IL-1β分泌或NF-κB信号通路被抑制时,肿瘤生长被抑制,OPN的表达水平与TNF-α和IL-1β的分泌显著相关)

结果展示   

1.通过scRNA - seq在HNSCC临床样本中鉴定肿瘤特异性SPP1+ mac

2.肿瘤特异性SPP1 + Macs与HNSCC不良预后呈正相关

3.SPP1 + Macs通过分泌细胞因子促进HNSCC进展

4.SPP1 + Mac衍生的TNF - α和IL - 1β在体外加速HNSCC细胞的增殖和迁移

5.SPP1 + Macs分泌TNF - α和IL - 1β受NF - κB信号通路调控

6.SPP1 + Mac衍生的TNF - α和IL - 1β促进巨噬细胞和肿瘤细胞中OPN的表达

7.SPP1 + Macs促进HNSCC在体内的进展

文章小结

怎么样,看下来思路是不是很清晰?其实这个肿瘤研究“三步法”的套路也可以适用在其它的肿瘤疾病中,大家可以大胆尝试,毕竟有课题窗这个后盾在。选题拿不准、或者遇到任何方案或者生信分析上的难题都可以来找课题窗,咱这的专业团队经验丰富,时刻为大家科研保驾护航!

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