Nature-skills 全流程AI助手:十大技能拆解,从润色到绘图一键搞定

技能全景：十大技能一览

一、nature-figure：科研绘图

核心功能：生成Nature级多面板图，支持Python（matplotlib/seaborn）和R（ggplot2/patchwork/ComplexHeatmap）两种后端。

强制规范：字体族设为sans-serif，指定Arial或DejaVu Sans，SVG字体类型设为none以保证文字节点可编辑。导出格式限定SVG/PDF/TIFF，符合高影响力期刊投稿标准。

工作流程（5步）：

1. 加载清单与核心层：读取manifest.yaml，声明backend轴及允许值

2. 检测后端：判断用户选择Python还是R，若未选则询问

3. 加载匹配的后端片段：只加载当前任务所需的后端配置

4. 构建图形：使用加载的材料生成图表

5. 导出与质检：按指定格式导出，执行QA检查

触发关键词：论文配图、科研绘图、画图、作图、出图、可视化。

典型用法：告诉AI“用R内置iris数据集，生成一张Nature风格的三面板组合图，导出为PDF”，它会自动执行从数据探索到图形拼接的全流程。

示例图库

下面的图像是按本技能规则生成的模拟数据 mockup：优先导出可编辑 SVG、使用克制的语义配色、小写 panel label，并采用非对称多面板信息结构。README 中展示的是 PNG 预览；正式使用时仍应从绘图脚本导出 SVG/PDF。

图表类型图谱

下面的图库按 chart family 分类。每张预览都是紧凑的 4 x 4 小面板 atlas，用来展示可组合进 Nature 风格结果图的视觉语法范围。

类型	预览	常见用途
柱状图		组间比较、有符号差值、组内分组设计、堆叠组成
折线与纵向趋势		时间过程、不确定性带、干预标记、个体轨迹
热图		Z-score 矩阵、连续丰度图、带注释表格、聚类块
散点与气泡图		相关性、簇、volcano-style 检验、象限总结、第三变量编码
雷达与极坐标图		多轴 benchmarking、圆形摘要、polar histogram、方向密度
分布图		直方图、小提琴图、箱线图、ridgeline 和样本级分布
Forest 与区间图		效应量、置信区间、点范围、配对斜率比较
面积与堆叠趋势		填充轨迹、份额堆叠、累计曲线、stream-like 构图
图像板		显微通道、叠加图、裁剪、比例尺和暗色面板
网络与矩阵图		气泡矩阵、邻接图、node-link 图和二分互作面板

二、nature-polishing：学术润色

核心功能：将中英文草稿润色为Nature风格的学术英语，基于写作策略原则、Nature/Nature Communications文章模式及Academic Phrasebank的句式库。同时覆盖LaTeX排版问题修复——松散页面、孤立章节标题、图表跨页、“Float too large”、多面板图排列等。

参数轴（4个维度）：

• paper_type：research / methods / hypothesis / algorithmic / review（默认research）

• section：abstract / intro / results / discussion / conclusion / title / methods（可多选，若用户未指定则询问）

• language：en 或 zh-to-en（从稿件本身检测）

• journal：nature / nat-comms / generic（默认generic；若用户指定Nature子刊则视为nature）

工作流程（5步）：

1. 加载清单与核心层：读取manifest.yaml，声明四个参数轴及允许值

2. 检测轴值：根据用户输入确定各轴取值，向用户确认

3. 加载匹配片段：只加载当前轴值对应的润色规则

4. 应用片段润色：按优先级应用核心立场、论文类型手册、章节规则、期刊规范、语言规则

5. 输出润色结果

触发关键词：润色、polish、改英文、学术写作润色、LaTeX排版修复。

三、nature-writing：论文撰写

核心功能：从零起草或重构Nature风格稿件各部分——摘要、引言、相关工作、方法、实验、讨论、结论、标题或完整手稿。

参数轴（与nature-polishing一致）：

• paper_type：research / methods / hypothesis / algorithmic / review

• section：abstract / intro / related-work / method / experiments / discussion / conclusion / title

• language：en 或 zh-to-en

• journal：nature / nat-comms / generic

工作流程（8步）：核心是先写一句话论点，再展开论证。如果关键证据或边界缺失，会写入占位符并在“Assumptions or missing”中列出。不跳过步骤1-3的规划阶段。

触发关键词：学术写作、写论文、写paper、SCI写作、搭论文框架、起草论文、写引言/摘要/讨论。

四、nature-citation：文献引用

核心功能：将稿件文本拆分为“可引用单元”，每个单元去Crossref等数据库检索，结果限定在Nature Portfolio、Science家族、Cell Press三家。默认导出一个参考文献管理器就绪的文件（EndNote/RIS/ENW/Zotero RDF）。

特别之处：与其他nature-*技能不同，nature-citation没有片段轴——它的变化来自运行时参数，而非不同的内容体。

运行时参数：

• journal scope：Nature系列 / CNS / CNS及子刊 / flagship-only（从用户措辞中读取，传给脚本--scope）

• user language：若用户用中文写作，遵循中文操作模式（中文笔记、英文检索词）

• input length：若超过约10个段落，切换为分批长文章策略

工作流程（4步）：

1. 加载清单与核心层：读取principles.md（严格期刊范围、来源层级、检索质量标准）和chinese-mode.md

2. 确认范围与语言：无内容轴，直接确认期刊范围和语言

3. 运行工作流：执行7步引用检索流程

4. 仅在需要时检索文献：按需调用检索

触发关键词：分段引用、自动给出引用、Nature系列引用、CNS及子刊、支撑文献、补引用、找引用。

五、nature-data：数据声明

核心功能：准备、审核或修订Nature就绪的Data Availability声明、数据仓库计划、数据集引用和FAIR元数据清单。

工作流程（8步）：

• 核心立场：数据可用性声明应包含什么、来源层级

• 中文用户操作模式：接受中文输入，起草英文声明，精准转换术语

• 无参数轴——变化在运行时处理，而非加载不同内容体

覆盖范围：数据仓库选择、登录号、受限或敏感数据、源数据、补充数据集、DataCite风格数据集引用。

触发关键词：数据可用性声明、数据共享、代码可用性、写数据声明、数据存放、数据仓库选择。

六、nature-reader：全文精读

核心功能：将论文整理成带原文、中文翻译、图表位置和来源锚定的Markdown阅读器。中英对照阅读，图文锚定。

特点：无参数轴，直接输入论文即可。适合快速精读文献、做文献笔记。

七、nature-response：审稿回复

核心功能：逐条回复审稿人意见，语气得体且可追踪。确保每条意见被完整处理、修改可追踪。

触发场景：收到审稿意见后需要逐条回复时。

八、nature-paper2ppt：论文转PPT

核心功能：将科学论文、预印本、PDF、文章文本、摘要、图注或阅读笔记转化为完整高效的中文组会汇报PPTX。

覆盖范围：从论文到中文PPT的完整转换流程。

九、nature-academic-search：文献检索

核心功能：多源文献检索、引文核验、MeSH检索策略、引文文件管理（.nbib/.ris/.bib转换）及参考文献管理（BibTeX、相关文章、ID转换），通过MCP工具（PubMed、CrossRef、arXiv、Scopus、ScienceDirect）实现。

参数轴（workflow）：

• multi-source-search：跨来源查找文献

• citation-verification：核验从文档中提取的引用

• mesh-strategy：构建MeSH/PubMed检索策略

• citation-file-mgmt：转换/管理.nbib/.ris/.bib文件

触发关键词：文献检索、查文献、找文献、文献综述检索、查论文、引文核对、参考文献管理、文献去重。

十、nature-reviewer：模拟审稿

核心功能：投稿前自审、审稿意见模拟、找论文问题。在正式投稿前用审稿人视角审视稿件，提前发现漏洞。

附录：参考文件索引

各技能目录下 references/ 文件夹包含详细的参考文件，以下按技能分类汇总：

nature-polishing（学术润色）

nature-writing（论文撰写）

nature-figure（科研绘图）

nature-citation（文献引用）

nature-data（数据声明）

nature-response（审稿回复）

nature-academic-search（文献检索）

网址链接：https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills/tree/main