ARTICLE · 1320943
脑区之间有多相似?MIND网络的原理与应用(附高分文献下载)

从结构MRI到个体脑网络
结构 MRI 分析经常从皮层厚度、表面积和灰质体积入手,寻找哪些脑区出现了改变。但一个脑区与其他脑区在形态上有多相似,也是值得研究的问题。MIND(Morphometric INverse Divergence,形态测量逆散度)利用脑区内部多种形态特征的分布,为每位被试构建皮层相似性网络,为常规 T1 加权图像提供了另一种分析视角。
这张网络的每个节点代表一个皮层脑区,每条边代表两个脑区的形态相似程度。理解这个定义,才能判断后续的差异脑图和统计结果究竟说明了什么。
一、为什么需要MIND?
结构 MRI 分析常用皮层厚度、表面积和灰质体积等指标,描述单个脑区的形态特征。在此基础上,还可以进一步研究:同一个人的不同脑区,在形态上有多相似?这种脑区间的形态关系,是否会随发育、衰老或疾病发生改变?形态相似性网络(Morphometric Similarity Network,MSN)和 MIND 都是研究这类问题的方法。
两者确实存在区别,可以先看一个例子。假设两个脑区的平均皮层厚度都是 2.5 mm,一个脑区的大多数顶点都接近这一数值,另一个脑区则同时包含较薄和较厚的部分。两者的平均厚度相同,内部的厚度分布却不同。如果同时考虑面积、曲率和沟深等特征,脑区之间的差异还可能体现在多种特征的组合关系上。仅用区域汇总值描述脑区,会丢失其中一部分信息。
MSN 和 MIND 均以 ROI 为节点,为每位被试构建“脑区×脑区”的相似性矩阵,区别在于如何表示脑区,以及如何计算边权。经典 MSN 通常将每个脑区的多种形态特征汇总并标准化,组成一个特征向量,再通过向量之间的相关系数衡量脑区间相似性。MIND 则利用各脑区内顶点级形态特征的联合分布,估计两个脑区分布之间的对称 KL 散度,并将其转换为相似度。因此,MIND 为利用脑区内部的形态分布信息提供了一种方法。
在实际研究中,MIND 可以补充回答:患者与对照之间,除了某些脑区的厚度或体积存在差异,脑区之间的形态相似性是否也发生了变化?将相似性网络与单脑区指标结合,可以同时考察区域本身的形态改变,以及区域之间的形态关系。
二、方法核心:比较脑区的多维形态分布
MIND 的标准输入来自皮层表面重建。可以把皮层表面想象成由许多顶点构成的网格,每个顶点都有一组形态测量值。原始研究使用五种特征:皮层厚度(CT)、表面积(SA)、顶点级灰质体积(Vol)、平均曲率(MC)和沟深(SD)。这些特征可由常规 T1 加权图像的FreeSurfer处理结果获得。
计算时,先在每位被试的全部有效皮层顶点上,分别对各特征进行标准化,再按脑区标签组织顶点数据。一个脑区因此对应一批多维观测值。这里比较的是这些特征的联合分布,并不是把五种特征各自计算一次后简单取平均。

图1.MIND 的计算逻辑。
算法使用近邻方法估计两个脑区分布的 KL 散度,并合并两个方向的散度,使结果具有对称性。将这个差异量记为 D,MIND 相似度的计算形式如下:
MIND(a, b) =11 + D(Pa,Pb)
公式中的两个 P 分别表示脑区 a、b 的多维特征分布。D 越小,MIND 越接近 1;D 越大,相似度越低。它利用了顶点级特征的分布信息,但没有直接保留或比较这些顶点在脑区内的空间排列。
三、从T1图像到个体相似性矩阵
第一步是数据整理与检查原始结构像。重点查看运动伪影、覆盖范围、明显信号异常。图像质量差异会影响形态测量,不能等到矩阵生成后才检查输入数据。
第二步是完成FreeSurfer皮层重建与质量控制。处理结果应包含皮层表面、顶点级形态特征和分区标签。需要检查白质面、软脑膜面与实际组织边界是否吻合,以及分区是否落在合理的解剖位置。重建错误会传递到相似性网络中。
第三步是准备一致的特征与脑区模板。标准实现读取 surf 目录中的lh/rh.thickness、area、volume、curv、sulc等特征,以及 label 目录中对应的 .annot文件。仅有每个脑区的平均厚度或体积表,还不足以恢复所需的顶点级分布。所有被试必须采用一致的特征定义、分区及标签顺序。
第四步是标准化顶点数据。标准化应在每位被试内部、跨其有效皮层顶点进行;不能把每个脑区分别标准化到相同分布,否则可能消除原本要比较的差异。具体过滤规则应与所采用的实现保持一致,并记录软件版本和参数。
第五步是计算和导出网络。将脑区两两配对计算相似度,得到每位被试的一张 R×R 矩阵,R 为保留的脑区数。导出时同时保存被试编号、行列标签、特征组合、分区名称和处理记录。若采用标准双侧 DK 68 区分区,在无额外缺失脑区的情况下,矩阵为 68×68。图2为DK子图谱308分区。

图2.MIND 的核心流程。来源Zeng et al., 2026。
四、如何分析和解读MIND结果
边水平分析关注具体脑区对。例如,额叶某区与颞叶某区之间的 MIND 降低,表示在当前特征和分区设定下,两者的形态分布更不相似。节点水平分析则可以计算某个脑区与其余脑区的平均相似度,概括这个脑区在整个相似性网络中的位置;部分研究将它称为节点加权度。
整体水平可以先考察全网络平均相似度及边权分布。如果进一步计算效率、聚类系数或最短路径,需要事先说明网络阈值、权重处理及相似度到距离的转换方式。
组间比较可使用一般线性模型,根据研究设计纳入年龄、性别、扫描站点和适当的图像质量指标等协变量;是否控制颅内容积需要结合特征组合与研究问题决定。比较大量边或节点时,明确检验范围,并采用 FDR 或 FWE 等错误率控制策略;使用置换检验时,也要说明如何控制多重比较。
相似度升高或降低本身没有固定的“好坏”方向。升高可能反映形态分布更趋近,降低可能反映更分化,也可能受到疾病或测量误差影响。

图3.MIND 边水平分析结果示意图。
五、应用场景一:脑发育与年龄相关差异
发育研究既关心单个脑区如何成熟,也关心脑区之间的形态关系如何随年龄变化。例如,某些脑区在儿童期具有相似的形态分布,随着发育可能出现不同程度的分化。MIND 可以把这种关系表示成可供统计分析的个体网络。
Sebenius等人的研究(2023)在 ABCD、HCP-D 和 HCP-YA 等队列中评估了MIND,其中 HCP-D 覆盖 8~21 岁,HCP-YA覆盖 21~35 岁。作者使用网络边权或节点加权度预测年龄,并比较了 MIND、MSN 以及部分数据中的扩散成像网络。该研究支持 MIND 包含年龄相关信息,但不同方法的表现仍取决于数据、特征和评价任务。

图4.MIND 网络中的年龄相关信息。a 比较不同年龄组平均网络的相似性;b、c 比较不同网络特征的年龄预测表现。
实际项目可以先分析边或节点指标与年龄的关系,再评估其与认知或行为表现的关联。横断面研究发现“不同年龄的人网络不同”,并不等同于证明“同一个人的网络随时间这样改变”。研究衰老或疾病进展时,需要相应年龄范围的数据;要描述个体变化轨迹,则应优先使用纵向设计,而不能直接把儿童和年轻成人队列的结果外推到老年人。
六、应用场景二:临床疾病中的形态关系变化
临床研究可以比较患者与健康对照的 MIND 网络,再考察差异是否与症状、认知或病程相关。与单脑区厚度或体积分析相比,这一步关注的是脑区之间的形态关系是否改变。两类结果可以并列解释,但不必期待它们在空间上完全重合。
García-San-Martín 等在 2025 年发表的研究,使用 352 名精神分裂症谱系障碍个体和 195 名健康对照的结构 MRI 构建 MIND 网络。研究观察到,患者的相似性降低主要涉及颞叶、扣带和岛叶,部分枕叶关系则升高。某些临床状态较差的亚组表现出更明显的改变,但不同量表的模式并不完全一致。
这个案例说明,组间差异不仅可以落在某一条边上,还可以通过节点平均相似度定位相关脑区,再与临床信息联系起来。需要留意的是,展示脑图时可能使用效应量、统计量或校正后的显著性;它们的颜色含义不同,不能只凭颜色判断“连接增强或减弱”。

图4.精神分裂症谱系障碍中的 MIND 差异及临床分层。A 展示患者相对对照的边和节点效应量,B、C 展示按临床状态分层后的结果。
结语
MIND 通过整合多种形态特征及其脑区内分布,它将丰富的皮层形态信息转化为可比较的个体网络表型,为研究脑发育、衰老和疾病中的形态关系变化提供了新的工具。对于已有的结构像队列,MIND 也提供了重新挖掘数据价值的机会,使研究者能够进一步联系认知表现、临床症状及其他生物学信息,探索脑区之间的形态组织如何体现个体差异。它为结构像研究带来的价值,正是从区域形态描述出发,进一步理解脑结构的组织及其与行为和疾病的关系。
参考文献
[1] Sebenius I, Seidlitz J, Warrier V, et al. Robust estimation of cortical similarity networks from brain MRI. Nature Neuroscience. 2023;26:1461–1471.
[2] García-San-Martín N, Bethlehem RAI, Segura P, et al. Reduced brain structural similarity is associated with maturation, neurobiological features, and clinical status in schizophrenia. Nature Communications. 2025;16:8745.
[3]Zeng, Y., Yang, L., Cui, Z., & Cao, Q. (2026). Cortical morphometric inverse divergence in attention-deficit/hyperactivity disorder correlates with cell-type-specific, laminar-specific and developmental transcriptomic signatures. Psychological Medicine, 56, e136.
[4]Bianco, M. G., Calomino, C., Novellino, F., Crasà, M., Augimeri, A., Quattrone, A., ... & Nisticò, R. (2026). MIND-Based Cortical Similarity Networks reveal distinct Cortical Alterations in Motor Subtypes of Parkinson’s Disease. NeuroImage, 122245.


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