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TCGA病理切片(2026版)下载,别再被 TCGA官方折磨了!!!

TCGA病理切片(2026版)下载,别再被 TCGA官方折磨了!!!

在此给同学们推荐一个专注于生信前沿的专业公众号,专业聚焦单细胞、空转、AI的交叉前沿研究,抓住了他便是抓住了生信领域的科技前沿

书接上回

针对TCGA官方下载工具gdc-client连接失败、下载速度慢、进度卡死等痛点。我于上篇文章发布了TCGA病理组学的下载+分析软件

收到了同学们积极的反响及需求——

  • 只需要病理切片下载功能

安排。


单独实现TCGA病理切片下载

上篇文章的软件集成了

下载→特征提取→模型训练 全流程

确实不是每位同学都用得上全部功能。

因此,将下载功能单独实现——

TCGA_SVS_Downloader

只做一件事:把TCGA病理切片满速下载到你的电脑上

一个安安静静的下载工具。


和官方 gdc-client 比怎么样?

此次功能提取并没有对任何下载功能进行阉割,依旧可以做到满速下载

没有对比就没有伤害,直接上表格👇

核心优势一句话

你只需要做三步——选项目、查文件、点下载。剩下的一切交给工具。


使用演示

第一步:选项目

打开软件,左侧是33种TCGA癌症列表,想下哪个勾选哪个。

以TCGA-ACC为例:

第二步:查文件

点击「查询SVS文件ID」,工具会自动请求GDC服务器,返回目标肿瘤的全部SVS切片信息。

以TCGA-ACC为例:323个SVS文件,共380.9GB

第三步:配置参数+下载

推荐参数设置:

  • 分片数:64
  • 超时秒数:10秒
  • 重试次数:30次

需要挂机下载的同学可以适当增加超时和重试次数

点「开始下载」,见证宽带跑满的快乐👇

下载完成后,文件保存在软件目录的 GDC_Slide/ 文件夹中,按肿瘤类型分目录存储,整整齐齐。


写在最后

这个工具没有花里胡哨的功能,就是老老实实帮你把TCGA病理切片下载下来。

如果你:

  • ✓ 被 gdc-client 折磨过
  • ✓ 只需要下载功能,不需要病理组学
  • ✓ 想要一个开箱即用的轻量工具

那它一定很合你胃口。

软件获取

软件定价:35元

购买方式:添加vx:sciwink此外,还给同学们准备了测试版,仅阉割了下载种类和数量,下载速度依旧是满血版,同学们可先进行速度测试。

测试版网盘链接

通过网盘分享的文件:TCGA_SVS_Downloader测试版.exe 链接: https://pan.baidu.com/s/1HIVcyuE-QRNVxoZxbESRNA 提取码: 4bzv –来自百度网盘超级会员v7的分享

测试版网盘二维码